Zbritoff rastlinskega mikrobioma

Antibiotiki so kemijske spojine, ki jih uporabljamo za zdravljenje bakterijskih okužb, saj zavirajo ali povzročajo propad bakterij. V zadnjem času predstavlja odpornost proti antibiotikom za javno zdravje resen in zaskrbljujoč problem. Če je bilo nekdaj antibiotik za zdravljenje določene okužbe mogoče nadomestiti z drugim antibiotikom, pa to z naraščajočim pojavom panrezistentnih organizmov, ki so odporni proti več antibiotikom hkrati, ni več možno. Poleg tega farmacevtska podjetja ne razvijajo novih antibiotikov, ker se jim to tudi zaradi strožjih regulatornih zahtev ne izplača. 

Raziskovalna skupina iz Italije se je z namenom, da odkrije mikroorganizme, ki izkazujejo protimikrobno aktivnost, odločila raziskati bakterijski mikrobiom aromatične rastlinice Origanum vulgare. Rastlino sicer bolje poznamo pod imenom origano. Njeno protimikrobno učinkovanje pa sicer pripisujemo fenolnim spojinam, predvsem različnim terpénom, kot so denimo timol, karvakrol, germakren D in beta-kariofilen. 

Raziskovalke in raziskovalci so tako z namenom raziskave mikrobioma origana najprej vzeli vzorce štirih različnih delov rastline: zemlje iz okolice korenine, stebla, listov in cveta. Odvzete vzorce so ustrezno redčili in razmazali na gojišče, po inkubaciji pa so nato iz vsake petrijevke izolirali bakterije iz 25  različnih kolonij. Izolate so poslali na molekularno analizo, ki je razkrila, da pripadajo 62  različnim bakterijskim sevom. Najbolj pogosti so bili pripadniki rodov Bacillus in Arthrobacter.

V prvem delu raziskave so raziskovalke in raziskovalci 62  izoliranih bakterijskih sevov najprej testirali na odpornost proti antibiotikom. Izkazalo se je, da je večina odpornih proti vsaj enemu antibiotiku, najbolj odporni proti več antibiotikom pa so bili bakterijski sevi iz zemlje. Testirali pa so tudi, kako bakterije iz različnih delov rastline vplivajo na medsebojno rast. Izmed njih so za drugi del raziskave izbrali 23  sevov, ki so najbolj omejevali rast drugih bakterij.

V drugem delu je bil nato izveden test protimikrobne aktivnosti 23 iz origana izoliranih bakterij proti 46 človeškim bakterijskim patogenom, ki povzročajo lokalne in sistemske okužbe. Test je pokazal, da ima skoraj polovica testiranih bakterij inhibitorno delovanje na patogene. Kar je bilo še posebej presenetljivo, je, da so bakterije origanovega mikrobioma na bakterijo Burkholderia cepacia, izolirano iz bolnikov in bolnic s cistično fibrozo, delovale bolj inhibitorno, kot ko je bila ta vzeta iz okoljskega vzorca. Raziskava je tako pokazala, da je potencialni rezervoar bioaktivnih učinkovin tudi mikrobiom medicinskih rastlin in ne samo njihove kemijske učinkovine.

Nad rastlinskimi mikrobiomi je očarana Teja.