Sledljivejši virusi

Raziskovalna skupina iz Nemčije je v reviji ACS Nano objavila izsledke raziskave, ki predstavljajo izboljšan pristop k analizi virusnih infekcij v treh dimenzijah. Novo orodje omogoča študijo patogenih virusnih delcev z uporabo nepatogenih vektorjev. Hkrati se zaradi uporabe vezavne ročice poveča specifičnost in jakost vezave med virusnim vezavnim proteinom z markersko molekulo. To omogoča natančnejše spremljanje poteka infekcije, brez vpliva na proces vezave.

Ob uporabi trenutno uveljavljenih načinov preučevanja interakcij med virusom in gostiteljsko celico se pogosto  spremeni jakost vezave med virusnim vezavnim proteinom in gostiteljsko celico. Raziskovalna skupina zato predlaga nov način za natančnejšo zaznavo interakcij. Ta temelji na specifični interakciji v času infekcije gostiteljske celice in sproščanja vektorskega markerja, zelenega fluorescenčnega proteina. 

V prvi fazi je raziskovalna skupina z metodo psevdotipizacije iz tarčnega, patogenega virusa prenesla zgolj zapis za tvorbo proteinov iz virusne ovojnice. Zapis za te proteine je bil vnešen v nepatogeni virusni vektor, ki vsebuje tudi zapis za tvorbo zelenega fluorescenčnega proteina. Slednji se začne izražati ob infekciji, torej ob interakciji virusnega vezavnega proteina z gostiteljskimi celicami. Preučevanje virusov je tako varnejše, hkrati pa se infektivnost novih virusnih delcev ob vezavi na tarčno celico ne zmanjša.

Ob infekciji gostiteljske celice s takim virusnim delcem se začne ekspresija virusnega genoma, vključno z markersko molekulo, zelenim fluorescenčnim proteinom. Tega je mogoče natančno lokalizirati v gostiteljski celici, kar omogoča natančnejše sledenje dogajanja v tarčni celici ob infekciji in spremljanje izražanja virusnih proteinov pod mikroskopom v treh dimenzijah v realnem času. 

V preteklih študijah se je izkazalo, da bolj uveljavljene metode spremljanja infektivnosti z uporabo antigenov vodijo v manj specifično vezavo, a to ne daje realne slike o interakciji virusa z gostiteljsko celico. Specifičnost in jakost vezave pa se z uporabo ročic in markerjev ne spremenita. 

Danes se je z virusi bojeval Tim.

Vir fotografije: "SARS Virus Particles" by National Institutes of Health (NIH) is marked with Public Domain Mark 1.0 .